zhongshilong 发表于 2012-5-1 22:13:59

介绍一个与药物基因组学有关的重要的数据库PharmGKB

由斯丹福大学牵头的遗传药理学和基因组药理学数据库(PharmGKB - The Pharmacogenetics & Pharmacogenomics knowledgebase)是一个对人类个体基因中存在的差异如何导致个体对药物反应差异进行研究的全国性(美国)研究联盟。科学家对随意搜集到的关于基因组、分子和细胞表表型以及临床的数据进行分析和组织后,把基因和药物的关系分为两个大的范畴:表型(包括:临床结果(CO),药效学和药物反应(PD),药物动力学(PK)以及分子和细胞功能化验(FA)); 基因型(GN)。目前,该数据库中包含有15188个基因与4654种药物和4067种疾病的相互作用资料。

连接如下:
http://pharmgkb.org/index.jsp

如果你想了解某条PKPD通路、通路基因、基因中重要功能的SNP,数据库提供重要信息。


chic 发表于 2012-5-3 11:45:19

感谢钟版主提供的这个数据库,省了我在pubmed来来回周旋的时间。
我想顺便问一下,有什么数据库可以提供某SNP在不同人种间的发生频率?
谢谢
目前我都是在pubmed的某个子库中查相关信息,感觉比较繁琐。

zhongshilong 发表于 2012-5-3 22:21:14

chic 发表于 2012-5-3 11:45 static/image/common/back.gif
感谢钟版主提供的这个数据库,省了我在pubmed来来回周旋的时间。
我想顺便问一下,有什么数据库可以提供某S ...

有几个选择:
1. dbSNP
2. hapmap
3. FastSNP
4. 使用bioconductor中的biomaRt软件包查找比较

chic 发表于 2012-5-4 11:03:55

zhongshilong 发表于 2012-5-3 22:21 static/image/common/back.gif
有几个选择:
1. dbSNP
2. hapmap


非常感谢,我之前似乎是用dbSNP和hapmap查的

panpan 发表于 2016-3-24 17:45:07

你好,请问如何注册pharmGKB?我注册的时候,不显示验证码
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